项目组合分析则从项目价值收益、项目所需资源与能力、项目风险和项目之间的依赖关系4个方面确定各项目的优先级。项目组合分析方法需要邀请若干具有经验的专家对每个项目从4个方面评价打分，根据专家评价的综合结果，确定项目的优先级。

从项目收益角度看，对于多数专家认为意义重大，收益很高的项目，应该考虑为首先建设的最高优先级；对于那些意义较大、收益较高的项目，则可以考虑为尽快建设的优先级；对于那些收益相对较低的项目则给予条件成熟时建设的优先级。

而从项目风险角度看，收益比较高的那些项目，往往也属于风险比较大的项目。在项目实施的时候要考虑风险因素，尽量选择收益／风险比大的项目优先实施。对于收益／风险比适中的项目，可以选择其中最重要的、收益／风险比相对较大的项目给予优先实施。

从项目依赖度角度看，越是高层的项目与其他项目的依赖度越高。生产运营层项目，一般具有一定的专业特性，对其他项目的依赖度相对较弱，而它又是高层应用项目的基本数据支撑，被依赖程度很高，一般可给予先行实施，为后续项目的依赖支撑做好准备。